生物肥料所含微生物的种类及其功能是决定产品应用效果的关键因素，选育、高效的功能性微生物是生物肥料产业竞争的至高点。生物肥料的生产菌种，是前提，高效是关键。
一个菌株，要想高效，须具备两个条件：
（1）能在土壤中存活并大量繁殖，这是基础条件；
（2）能分泌某种物质，且在极其微量时，即可与植物（或其生境）发生强烈的相互作用，这是关键条件。
目前，能同时满足这两类条件，且在生产实践中取得良好应用效果的功能性微生物，以papm（植物化感菌群）为引人注目。
一、papm的概念及发展历程
papm，即“植物化感菌群”，全称“植物正效应化感物质产生菌（plant positive allelochemicals producing microorganisms，papm）”，泛指可以产生对植物具有正效应的化感物质的有益微生物。papm产生的化感物质作为一种特殊的信号分子，可诱导植物信号通路或基因表达发生改变，使植物体发生相应的变化，从而具有促进植物生长发育、增强植物抗逆与抗病能力、提高农产品产量与质量的作用。
化感物质（allelochemical）是生物体内产生的非营养性物质，能影响其他植物生长、健康、行为或群体关系，化感物质是化感作用的媒介，主要是植物（包括微生物）的次生代谢物质。化感作用的英文为“allelopathy”，它源于希腊语“allelon（相互）”和“pathos（作用）”。植物化感作用的概念是由德国科学家h.molish在1937年首先提出的，molish将化感作用定义为所有类型植物（含微生物）之间生物化学物质的相互作用。同时molish指出，这种相互作用包括有害和有益两个方面。
20世纪70年代中期e.l.rice根据h.molish的定义和对植物化感作用的研究，认为：植物化感作用是指植物（含微生物）通过释放化学物质到环境中而产生的对其他植物（含微生物）直接或间接的相互作用。1984年rice在《allelopathy》第二版中，将化感作用较完整的定义为：植物或微生物的代谢分必物对环境中其他植物或微生物有利或不利的作用。这个定义现已被广泛的接受。
有些微生物可以产生对植物具有正效应的化感物质，从这些微生物中选育高效菌株并应用于农业生产，是世界各国的研究热点。山东佐田氏生物科技有限公司与山东农业大学合作，选育出十余株、高效的papm菌株，并成功的将其产业化应用，开发出一系列生物肥料产品。papm产品因应用效果良好，市场份额逐年增大，佐田氏公司也因此迅速发展壮大，现成长为国内大、强的生物肥料生产企业之一。
二、papm的作用与机理
papm的作用可以概括为以下几个方面：
（1）促进植物的生长发育，使植物长势健壮，提前成熟；
（2）诱导植物产生系统抗性，增强自身的抗逆能力；
（3）增加植物代谢产物的积累，提高产量，改善品质；
（4）抑制植物病原菌，减少病害发生；
（5）抑制植物害虫和食草动物的摄食量；
（6）改善土壤的理化性质和生态环境。值得说明的是，不同的papm菌株，功能有所区别，各有各优势。
概括的讲，papm产生的化感物质可通过以下途径发挥作用：影响细胞膜的结构和功能；影响呼吸作用；影响光合作用；影响水分吸收；影响激素的代谢；影响酶系统；影响蛋白质的合成；影响基因系统的表达。总之，papm作用于植物的效应和机理具有多样性和复杂性：一方面，一种化感物质常具有多种生理作用； 另一方面，植物生理性状的改变，往往是多种化感物质共同作用的结果。
三、papm与pgpr的区别与联系
papm与pgpr是两个既有区别又有联系的概念。pgpr是指生存在植物根圈范围中，对植物生长有促进或对病原菌有拮抗作用的有益微生物的统称，是从微生物的生境和作用的角度进行界定。而papm是指可以产生植物化感物质的有益微生物的统称，是从微生物与植物互作的角度进行描述和界定的。
pgpr中，仅有部分高效菌株可产生植物化感物质，也属于papm。但并不是所有的pgpr都能产生化感物质，不是所有的pgpr都是papm。同样的，生活在植物根际土壤的papm也属于pgpr的范畴，但有些papm不是来源于土壤，因此，也不属于pgpr的范畴。
四、papm的生物类群
papm广泛存在于自然界中。微生物与植物的互作是普遍存在的，其中微生物通过产生某种次级代谢产物与植物进行互作是常见的互作方式。据文献报道，细菌、放线菌、酵母、丝状真菌等微生物类群中都有一些种属或菌株可以产生化感物质，与植物有着较强的互作效应。这些微生物中，有的菌株具有很好的农业应用效果，可以用于生产微生物肥料和微生物农药等农用微生物菌剂。
必须说明的是，同名异株的微生物，在功能上可能具有天壤之别。同一种微生物，有的菌株是papm，有的菌株则不是papm。以枯草芽孢杆菌为例：不同厂家所用枯草芽孢杆菌虽然名字相同，但因采用的是不同的菌株，应用效果上具有很大的差异。可以这么解释，更便于理解：“枯草芽孢杆菌”在分类学上是一个“种”的名字（可以用“人”进行类比，是“人类”这个物种的名字），不同“菌株”（相当于不同的人，例如张三、李四）差别很大，作用各异（例如，张三是科学家，李四是艺术家）。因此，有的枯草芽孢杆菌菌株属于papm，有的则不是papm。
山东佐田氏生物科技有限公司是国内早应用papm生产微生物肥料的公司之一，其选育的哈茨木霉菌、枯草芽孢杆菌、地衣芽孢杆菌、交互链格孢、多粘类芽孢杆菌、淡紫拟青霉等papm菌株均可产生高效的植物化感物质，在农业生产中取得了很好的应用效果。2015年，papm产品研发获得山东省科技重大专项（新兴产业）立项——《新型高效抗病-抗重茬多功能生物肥料的研制与应用示范》，这大大推动了papm产品的研发与技术升级。
同时，公司于9月21日被拟认定为山东“省级企业技术中心”，今后公司将会依托“省级企业技术中心”这一研发平台，进一步深入papm技术的研究，加快papm技术成果的转化速度，加大papm系列产品的推广应用力度。